Die junge Corto ist die beste Drohnen-Pilotin ihrer Heimatinsel Nuii. Um ihre Heimat vor dem steigenden Meeresspiegel zu retten, nimmt sie mit ihren Freunden Enki und Mouse an einem Drohnenwettkampf teil: dem Whale Cup.

Während einer offiziellen Zealot-Zeremonie begeht Corto einen schweren Fehler und ruiniert aus Versehen ein Aqua-Relikt, das Ifa an die Königin liefern sollte. Corto versteht nicht, wie ernst ihr Vergehen war und warum die Zealots so aufgebracht sind, nur wegen einer „simplen Zeichnung“. Unglücklicherweise müssen die Tikis im nächsten Rennen gegen die Zealots antreten, und das auch noch auf deren Grund: auf der Tortuga-Strecke in der Stadt.

Noch ist der drohende Untergang der Heimatinsel unserer Protagonistin Corto nicht gebannt. Meister Whale hat zwar schon Ideen für neue Erfindungen, doch um sie anzutreiben, benötigt er die Energie möglichst vieler Aqua-Kristalle. Und nur eine Person besitzt so viele: Die Rost-Königin Scarlett, die über die Schildkröteninsel Tortuga herrscht. Um Zugang zu ihrem Schatz und ihren unzähligen Aqua-Schätzen zu erhalten, müssen die Tikis ein weiteres Drohnen-Rennen gewinnen: den Rotor-Punch.