Bei einem Besuch im Haus ihrer Kindheit finden Frasier und Niles einen menschlichen Schädel und sind besessen davon, zu beweisen, dass ihr ehemaliger Vermieter seine Frau ermordet hat.

Zu Beginn der neunten Staffel steht Frasier an einem romantischen Scheideweg und ist hin- und hergerissen zwischen seiner treuen Geliebten Claire und seiner lockeren Highschool-Liebe Lana. Frasier erlebt eine Fantasie, in der seine Ex-Frau Lilith und die ehemalige Cheers-Darstellerin Diane Chambers vorkommen. Im Staffelfinale wollen Niles und Daphne durchbrennen, anstatt die von ihren Familien geplante Hochzeit zu vollziehen. Die Streithähne Frasier und Roz schlafen schließlich miteinander.