Kaibas Luftschiff wird vom geheimnisvollen Noah und seinen Handlangern gekapert. Diese sind fünf bekannte Feinde aus Yugis und Kaibas Vergangenheit, die nach Rache sinnen!

Yugi ist für sein Alter ein wenig klein und dem gnadenlosen Spott seiner Mitschüler ausgesetzt. Seine geheime Wunderwaffe ist das Millenniumspuzzle, ein geheimnisumwittertes ägyptisches Medaillon, das er von seinem Großvater geschenkt bekam. Dieses Medaillon verwandelt Yugi, seitdem er das knifflige Puzzle zusammengesetzt hat, bei Gefahr in sein stärkeres und respekteinflößendes Alter Ego, Yu-Gi-Oh, den König des Spiels. Als dieser ist Yugi nahezu unschlagbar. Doch jede Menge Gegner und ein dunkles und gefahrenvolles Mysterium in Form eines super-spannendes Battle-Card-Spiels warten auf den noch ahnungslosen Yugi...