Nach einer Meuterei gegen den rücksichtslosen Kapitän Nemo gerät die Nautilus unter neuem Kommando in tödliche Gefahr. Von metallfressenden Käfern heimgesucht, muss die zerstrittene Crew nun wieder zusammenhalten, um zu überleben.

Nemo will mit der Nautilus auf eine gefährliche Reise unter das arktische Eis gehen. Da er alle Bedenken der Crew ignoriert, kippt die Stimmung an Bord. Es kommt zur Meuterei. Die anderen haben sich schon mehrfach über Nemos autoritäre Art und seine mangelnde Rücksichtnahme geärgert. Nun ist das Maß voll. Boniface wird neuer Kapitän. Als Nemo die Meuterer mit einer Schusswaffe bedroht, sperren sie ihn in seiner Kabine ein. Humility (Georgia Flood) versucht die Wogen zu glätten und redet Nemo (Shazad Latif) ins Gewissen. Sie fordert ihn auf, besser mit der Crew zusammenzuarbeiten und sie nicht mehr durch seine Rachsucht gegenüber der Company in Gefahr zu bringen. Doch er zeigt zunächst wenig Einsicht. Boniface (Pacharo Mzembe) nimmt Kurs auf Nagasaki, um die Nautilus dort zu verkaufen. In der Nähe des magnetischen Nordpols gerät das U-Boot allerdings in Turbulenzen. Zudem wird es von metallfressenden Käfern heimgesucht. Um die drohende Katastrophe abzuwenden, ziehen alle an Bord wieder an einem Strang - auch Nemo.