Die Serie handelt von einem mysteriösen Zeitreisenden, der nur als "Der Doktor" bekannt ist. Er reist mit seinen Begleitern in der Zeit-Raum-Maschine TARDIS, die als eine alte Polizei-Notrufzelle getarnt ist.

Auf dem Weg zu ihrem Heimatplaneten Gallifrey geraten der Doktor und Romana in ein Paralleluniversum: Den E-Space. Sie landen auf dem Planeten Alzarius und begegnen auf der Oberfläche der Crew eines Raumschiffs, das bereits vor Generationen hier abgestürzt ist. Der Doktor versucht, den Gestrandeten zu helfen, ihr Raumschiff zu reparieren, um zu ihrem Heimatplaneten Terradon zurückzukehren. Doch während sich aus dem Nebel Sumpfwesen erheben und Romana von Riesenspinnen attackiert wird, stößt der Doktor auf das uralte, genetische Rätsel des Planeten Alzarius... Mit 'Verschollen im E-Space', dem ersten Teil der E-Space Trilogie, beginnt für den Doktor (Tom Baker), der Time Lady Romana (Lalla Ward) und ihrem neuen Begleiter Adric (Matthew Waterhouse) ein spannendes Abenteuer im Paralleluniversum.